Губка Боб и его лучший друг Патрик, движимые жаждой приключений и детским любопытством, решаются на невероятно смелое путешествие. Их цель – самые мрачные и неизведанные глубины океана, где, по слухам, обитает легендарный и устрашающий призрак Летучего Голландца. Эта фигура, окутанная морскими мифами и историями, манит их как величайшая загадка, которую только можно представить под толщей воды. С самого начала пути друзей ждут неожиданные испытания: таинственные течения уносят их прочь от знакомых рифов, а окружающий пейзаж постепенно преображается, становясь все более чуждым и загадочным. Они сталкиваются с биолюминесцентными существами, чей свет лишь подчеркивает непроглядную тьму вокруг, и находят древние следы цивилизаций, давно забытых обитателями Бикини Боттом. Каждый новый поворот открывает перед ними очередную морскую тайну, заставляя Губку Боба и Патрика по-новому взглянуть на мир, который, как им казалось, они знали вдоль и поперек. Их путешествие превращается не просто в поиск призрака, а в настоящее исследование границ собственной смелости и дружбы, которая проходит проверку в условиях нарастающей опасности. Тем временем на поверхности, вернее, в более привычных районах их подводного городка, разворачивается не менее напряженная история. Мистер Крабс и Сквидвард, обнаружив исчезновение Губки Боба и Патрика и узнав об их опасном намерении, пускаются в собственную экспедицию. Их мотивы, конечно, разнятся: для мистера Крабса его лучший работник – это, прежде всего, ценный актив, чье отсутствие грозит убытками для «Красти Краб», а для вечно раздраженного Сквидварда это, возможно, больше вопрос долга и скрытой, глубоко запрятанной заботы о надоедливом, но ставшем привычным соседе. Вдвоем они идут по следу, оставленному неосторожными искателями приключений, и их путь оказывается полон неожиданных препятствий. Им приходится расшифровывать странные знаки, оставленные Губкой Бобом, сталкиваться с теми же аномалиями глубин, но уже с позиции тех, кто пытается не исследовать, а спасти. Их путешествие, полное комичных стычек и взаимных упреков, постепенно раскрывает неочевидные грани их характеров, превращая вынужденный дуэт в некое подобие спасательной команды. Пока Губка Боб и Патрик погружаются все глубже навстречу мистической встрече, их невольные спасатели из последних сил стараются нагнать их, и от этого параллельного путешествия зависит, смогут ли все герои благополучно вернуться домой, обогащенные новым, пусть и пугающим, опытом.